Moleküllerin görselleştirilmesi, analiz edilmesi ve simulasyonu,

KAYNAK AÇIKLAMA
Hyperchem Demo HyperChem 10 günlük kullanym demosu için tyklayyn.
Eğitimde HyperChem

E?itimde HyperChem kullanym örnekleri, dosyalary...

Hypercube Inc. Web Hypercube Web sayfasyna Link
  • Moleküler dinamik animasyonu ile kimyasal reaksiyon analizleri ve çarpy?an moleküllerin görsellenmesi, vb..
  • UV-görünebilirli?i ve IR spektrumlary v.b. hesaplamalary
  • Periodik tablodan elementi seçip molekül tasla?y in?a etme
  • Peptidler, nükleik asitler ve amino asitler
  • Geometri optimizasyonu, moleküler dinamik simulasyonu ve single-point hesaplamalar
  • Yörünge enerji seviyesi ve yörüngelerin kontur çizimi
  • Titre?im modlarynyn animasyonu
  • Kolayca molekül yaratma: Periyodik tablodan eleman seçip fare ile kimyasal yapynyn içine ta?yma
  • Model yaratycy ile çizimler 3 boyutlu yapylara dönü?ür; Karma?yk metal yapylary dahi görüntüler
  • Çubuk, daire/ küre, silindir: gölgeleme seçenekleriyle görüntüleme
  • Stereo görüntü, yörünge, elektron yo?unluklary veya kontur grafikler
  • Olu?um ysysy, iyonla?ma potansiyeli, elektron ilgisi, dipol momenti
  • Molekül mekani?i ve yary ampirik kuantum mekani?i hesaplamalary
 

YENY SÜRÜMDE:

Open GL Görüntüleme

Artyk Hyperchem içinde tüm moleküler gösterimle OpenGL modellemesi ile gerçekle?iyor: çok daha kaliteli grafiksel sunumlar, çyktylar alabileceksiniz.

 

Ki?isel Renk Kullanma

Artyk molekülleri, geriplanlary istedi?iniz renkte gösterebilirsiniz (geçmi?te sadece 8 standart renk vardy)

 

Kary?yk Görüntüleme

Ayny molekülün farkly kysymlaryny farkly görüntüleme imkany. Herhangi bir atom istenilen gösterimde olabilir: çizgi, top, top ve çizgi, vesaire...

 

Atomlary Tüp ?eklinde Gösterebilirsiniz...

 

Protein Yapylaryny De?i?tirme

Protein yapylary ile çaly?mada yeni birçok özellik eklendi. Artyk 4 adet ikincil yapy tanymy girebilirsiniz: helixler, yapraklar, çevrimler ve döngüler... Ykincil yapylar tek tek seçilebilir, renklendirilebilir ve görsellenir.

 

Protein Veri Banka Dosyalarynda Ykincil Yapy Deste?i

HyperChem molekül dosyalarynda ikincil yapylary destekliyor. Protein veritabanyndaki (PDB) bilgiler HIN dosyalarynda korunur. Peptid olu?turucu da bu yeni seçene?i destekliyor.

 

Geli?mi? Protein Olu?turucu

Alfa ve beta helixlerine ek olarak peptid olu?turucuda beta turn, paralel ve anti-paralel beta yapraklary, soldan alfa helixler, 310-helix, ve pi-helix mevcuttur.

 

Büyük Molekül Elektron Özkütle Hesaby

Yeni ve hyzly bir metodla elektron özkütle hesaby ve gösterimi gerçekle?tiriliyor. Mesela, büyük proteinlerin elektron yo?unlu?u hyzla gösterilebiliyor.